臺灣教門的第二個特征是關公崇拜。在臺灣教門中，關公享有崇高的地位。民間傳說，關公封神后不久便繼任為玉帝，執掌人間生死。在1864年的一份教門文獻中，教門聲稱在新一輪的甲子年里，五教（儒、釋、道、伊斯蘭、基督教）創始人公推關帝繼承玉帝的位置，這種說法令人不禁想起每隔一段時間便會舉行一次的總統大選。作者還在臺灣高雄的一座廟里親眼看到了身著民間信仰中玉皇大帝服飾的關公像。教門中人對關公的喜愛固然同《三國演義》中關羽的忠義形象有關——這種忠肝義膽本身也是教門團結的象征，另一方面也涉及到關公在商業上的形象——財神。據傳聞，在日據時代，臺灣的關公曾經多次懲罰使用日貨和結交日本人的臺灣人，保護本土商人。這種商業護法神的形象深入人心，使得關公成為教門、政府與社會精英一致認同的宗教符號，隱喻著忠誠和義氣。然而，對政府的忠未必等于對教門的義，有時二者也會發生沖突。因此關公崇拜同時包含著反叛與正統兩種傾向。

身著玉帝服飾的關帝像。民間信仰認為，關公為第十八任玉皇大帝，至今仍在統攝天庭

許多對教門稍有了解的人都會注意到教門文化的混合特征。這種混合特征體現在教門往往會借用其他宗教的象征符號，拼湊成自己的教門文化。對于這種借用，教門稱之為“三教唯一”。他們對儒釋道三教的教義加以重新解讀，聲稱自己的教義是高于三教的更高權威。教門常常會將正統宗教的象征符號抽離出正統的宗教文本，用本教門的教義進行解讀，使其符合本教門的理念。比如，一貫道主張“萬教歸一”，他們聲稱《論語》中早有此說法，即“吾道一以貫之”，這就是一貫道名稱的由來。

中共建政初年對一貫道進行批判活動。一貫道發端于晚清，極盛于1940年代。1946年，國民政府曾公告各地取締“一貫道”，但最后無疾而終。1950年，北京政府下令，逮捕一貫道首要分子。一貫道遂一蹶不振，其教眾流亡臺灣，最后于80年代重新出現。

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